Mata kuliah ini membahas tentang mikroba akuatik meliputi ruang lingkup, struktur mikroba, media, pertumbuhan, ekologi, metabolisme, identifikasi, taksonomi bakteri, virus, fungi, alga, dan protozoa, pengendaliannya serta peranannya dalam kegiatan akuakultur.
Pembelajaran dengan pendekatan student centered learning, dengan praktikum dan team based project.